交通部日前公布兩岸小三通規畫原則，初期先開放海運通航，並以一區一港為原則，採定點、定期、定線方式進行；初期規劃「金門料羅港──廈門」、「馬祖福澳港──福州」兩條航線；至於通航的船舶必須為客輪及貨輪。
小三通，千呼萬喚始出來，真令人感觸良多。金門、馬祖原是福建的一部分，無論地緣、血緣，距大陸遠近於距台灣，但政治因素卻把金門、馬祖綁入了「台、澎、金、馬」這一塊，與近在咫尺的福建卻反倒成了老死不相往來的「敵對關係」。隨著兩岸大政經關係的演變，金門與廈門、馬祖與福州之間的小政經關係自然也受到牽動，經濟、社會的民間因素終於浮現出來，向既有的政治、軍事的公權力權威逐漸形成一波強過一波的挑戰。雙邊經濟活動日趨頻繁，但兩岸當局卻有不同的處理態度，在台灣，視之於非法的走私，在大陸，卻視之於合法的小額貿易，夾在中間的老百姓，則在遵守法律與服從經濟規律之間備感為難，動輒得咎。此外，由於金、馬與福建之間，醫療資源與水資源存有差距，兩地之間如能通水及使金、馬居民在必要時能到對岸就醫，無論就生活便利及人道上均有必要，但此等交流亦因受制於兩岸大政經形勢無法進行。
一九九三年，兩岸「辜汪會談」在新加坡舉行，大陸海協會會長汪道涵第一次正式提出「兩馬（馬祖與馬尾）先行」、「兩門（金門與廈門）對開」的小三通建議。台灣當局認為這是中共的統戰，且自恃三通乃己方最大籌碼，乃不予理會。未料不過幾年時間，兩岸之間，政經情勢丕變，一方面大陸經濟成長速率快過台灣，兩岸經濟差距有明顯縮小之勢，經濟（如拒絕三通、採取戒急用忍）做為台灣籌碼的價值快速流失，反倒成為台灣產業發展的匡限，也正因為如此，逐漸蘊積成另方面質疑、挑戰台灣當局政策的民間壓力。迫於此等形勢，新政府乃至於民進黨不得不在三通政策上有所調整。但大三通畢竟動見觀瞻，且必然涉及兩岸當局在中共所設前提即「一個中國」原則下的政治談判，故為台北當局排拒，於是乃從小三通入手，試圖由小三通「引渡」到大三通。
